Η αποστολή των μεταπτυχιακών προγραμμάτων του τμήματος Πολιτικών Μηχανικών & Μηχανικών Περιβάλλοντος είναι η προώθηση ακαδημαϊκής έρευνας που οδηγεί στην ανακάλυψη, την εκμάθηση και την καινοτομία σύμφωνα με διεθνή πρότυπα, στον ευρύτερο τομέα της επιστήμης του πολιτικού και περιβαλλοντικού μηχανικού, καθώς επίσης και στους σχετικούς διεπιστημονικούς τομείς. Τα μεταπτυχιακά προγράμματα προσανατολίζονται στην έρευνα προκειμένου να υποστηριχθεί και να ενισχυθούν οι ερευνητικές και εκπαιδευτικές δραστηριότητες του τμήματος και του πανεπιστημίου.